Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN1Q16658 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FSCN1Q16658 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN1Q16658 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN1Q16658 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN1Q16658 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN1Q16658 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN1Q16658 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN1Q16658 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN1Q16658 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN1Q16658 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN1Q16658 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN1Q16658 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms