Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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