Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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