Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B3Q15393 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
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