Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
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