Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC7Q15024 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC7Q15024 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC7Q15024 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC7Q15024 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC7Q15024 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC7Q15024 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC7Q15024 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC7Q15024 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC7Q15024 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC7Q15024 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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