Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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