Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MDC1Q14676 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MDC1Q14676 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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