Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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