Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms