Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF4BQ13523 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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