Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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