Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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