Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENBP1Q13228 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENBP1Q13228 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENBP1Q13228 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SELENBP1Q13228 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms