Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A2Q12974 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
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