Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC20Q12834 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC20Q12834 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC20Q12834 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC20Q12834 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC20Q12834 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC20Q12834 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC20Q12834 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC20Q12834 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC20Q12834 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC20Q12834 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC20Q12834 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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