Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPTFQ12830 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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