Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 FZF1YGL254W 900 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 VEL1YGL258W 621 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 YPL113CYPL113C 1191 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 ROG1YGL144C 2058 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 GUS1YGL245W 2127 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 NUP133YKR082W 3474 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 YHL049CYHL049C 816 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 MSN1YOL116W 1149 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 YLR001CYLR001C 2589 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 THI20YOL055C 1656 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 SEC18YBR080C 2277 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 YIL169CYIL169C 2988 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 CIT1YNR001C 1440 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 TRE1YPL176C 2352 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 RRN11YML043C 1524 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 PDR3YBL005W 2931 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 NOP2YNL061W 1857 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 HEH2YDR458C 1992 nt4.59□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 YPR136CYPR136C 513 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 NUP85YJR042W 2235 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 PPZ1YML016C 2079 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 PEX18YHR160C 852 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 PSK2YOL045W 3306 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 YML037CYML037C 1023 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 ADD37YMR184W 597 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 TUM1YOR251C 915 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 YOR283WYOR283W 693 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 snR43snR43 209 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 XRN1YGL173C 4587 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 YPS6YIR039C 1614 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 RIM21YNL294C 1602 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 GCN5YGR252W 1320 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 SME1YOR159C 285 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 DIB1YPR082C 432 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 DDC1YPL194W 1839 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 RAD26YJR035W 3258 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 DAN4YJR151C 3486 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 ATP5YDR298C 639 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 BIO2YGR286C 1128 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 BMS1YPL217C 3552 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 SIR1YKR101W 1965 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 RSM24YDR175C 960 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 AIM25YJR100C 984 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 TOM40YMR203W 1164 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 PEX32YBR168W 1242 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 ARO10YDR380W 1908 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 PRP9YDL030W 1593 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 ABD1YBR236C 1311 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 TAF1YGR274C 3201 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 PRP28YDR243C 1767 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 YDR396WYDR396W 501 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 NIS1YNL078W 1224 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 PNG1YPL096W 1092 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 CWH41YGL027C 2502 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 YER084WYER084W 387 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 ERP6YGL002W 651 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 ATP4YPL078C 735 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 SPT23YKL020C 3249 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 ARO9YHR137W 1542 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-GR3Q12316 CAX4YGR036C 720 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 PRX1YBL064C 786 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 RGC1YPR115W 3252 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 MMR1YLR190W 1476 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 BLM10YFL007W 6432 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YER134CYER134C 537 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 RPS21AYKR057W 264 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 ILS1YBL076C 3219 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 SMC6YLR383W 3345 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YPL109CYPL109C 1974 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 TMA108YIL137C 2841 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 GUF1YLR289W 1938 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 PMS1YNL082W 2622 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 PRS5YOL061W 1491 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 RNR2YJL026W 1200 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 RDL2YOR286W 450 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YFL040WYFL040W 1623 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 ZDS1YMR273C 2748 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YPK9YOR291W 4419 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 FRE7YOL152W 1863 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YPL150WYPL150W 2706 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 DCS1YLR270W 1053 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YLR297WYLR297W 390 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 DCV1YFR012W 609 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YIL175WYIL175W 318 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 CHA4YLR098C 1947 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 ESF1YDR365C 1887 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 CMR1YDL156W 1569 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 CSM3YMR048W 954 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 GRE1YPL223C 507 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YDL180WYDL180W 1644 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 SPO16YHR153C 597 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YDR186CYDR186C 2634 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 FKH1YIL131C 1455 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YKR070WYKR070W 1059 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-GR3Q12316 YOR022CYOR022C 2148 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 SPT6YGR116W 4356 nt4.45□□□□□ -1.7
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