Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms