Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP4Q07065 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms