Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51Q06609 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms