Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms