Protein–RNA interactions for Protein: Q06063

DUS4, tRNA-dihydrouridine(20a/20b) synthase [NAD(P)+], yeastyeast

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DUS4Q06063 YFL040WYFL040W 1623 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 UTP5YDR398W 1932 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 NOP58YOR310C 1536 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 GMC1YDR506C 1827 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 BUD8YLR353W 1812 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 ARF2YDL137W 546 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 PET100YDR079W 336 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 SRB7YDR308C 423 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YGL199CYGL199C 471 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 LNP1YHR192W 837 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YAL069WYAL069W 315 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 MAP1YLR244C 1164 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 ATP19YOL077W-A 207 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 ZPS1YOL154W 750 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 FDH2YPL275W 711 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 SUE1YPR151C 621 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 HES1YOR237W 1305 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 ROG3YFR022W 2202 nt5.19□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 RDI1YDL135C 609 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YDR203WYDR203W 318 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YGL088WYGL088W 366 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YGL117WYGL117W 798 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YGL204CYGL204C 306 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 UPF3YGR072W 1164 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YGR149WYGR149W 1299 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 SWD2YKL018W 990 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YHC1YLR298C 696 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 TOM7YNL070W 183 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 CST6YIL036W 1764 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 AZR1YGR224W 1842 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 HAP1YLR256W 4509 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YMR102CYMR102C 2505 nt5.18□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 SMP1YBR182C 1359 nt5.17□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 ROT2YBR229C 2865 nt5.17□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 PCT1YGR202C 1275 nt5.17□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 PRS3YHL011C 963 nt5.17□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.17□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.17□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 ERG9YHR190W 1335 nt5.17□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 CTS2YDR371W 1536 nt5.17□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 UGA1YGR019W 1416 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 OXP1YKL215C 3861 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YDR417CYDR417C 372 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 RPL12AYEL054C 498 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 RTR1YER139C 681 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 TYW3YGL050W 822 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 SNL1YIL016W 480 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 GLG2YJL137C 1143 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 RLP24YLR009W 600 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 RPL15BYMR121C 615 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 ARF3YOR094W 552 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 TRS33YOR115C 807 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 TUM1YOR251C 915 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 RRP3YHR065C 1506 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 YLR446WYLR446W 1302 nt5.16□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.15□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 TCM62YBR044C 1719 nt5.15□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 UBP9YER098W 2265 nt5.15□□□□□ -1.58
DUS4Q06063 MEI4YER044C-A 1227 nt5.15□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 THI11YJR156C 1023 nt5.15□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt5.15□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YOR105WYOR105W 327 nt5.15□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 SPN1YPR133C 1233 nt5.15□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt5.15□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 ASA1YPR085C 1332 nt5.15□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 RGL1YPL066W 1440 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 GDB1YPR184W 4611 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 URK1YNR012W 1506 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 KTR7YIL085C 1554 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YGR122WYGR122W 1209 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 TRX2YGR209C 315 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 DBP8YHR169W 1296 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 STE18YJR086W 333 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 SDH3YKL141W 597 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 SHE1YBL031W 1017 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 IZH2YOL002C 954 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 AIM39YOL053W 1188 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 CIN5YOR028C 888 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YPR078CYPR078C 1119 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YPR172WYPR172W 603 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 ELP2YGR200C 2367 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 SSH4YKL124W 1740 nt5.14□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 PDE1YGL248W 1110 nt5.13□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 MMF1YIL051C 438 nt5.13□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt5.13□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 SOL1YNR034W 966 nt5.13□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 ICY2YPL250C 411 nt5.13□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YHR202WYHR202W 1809 nt5.13□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 RUD3YOR216C 1455 nt5.13□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.12□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 PCL7YIL050W 858 nt5.12□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 RFU1YLR073C 603 nt5.12□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YNL181WYNL181W 1224 nt5.12□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YPL205CYPL205C 345 nt5.12□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 YPL278CYPL278C 303 nt5.12□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 QCR2YPR191W 1107 nt5.12□□□□□ -1.59
DUS4Q06063 NUP1YOR098C 3231 nt5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms