Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms