Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RELQ04864 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RELQ04864 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RELQ04864 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RELQ04864 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RELQ04864 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RELQ04864 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RELQ04864 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RELQ04864 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RELQ04864 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RELQ04864 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RELQ04864 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RELQ04864 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RELQ04864 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RELQ04864 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RELQ04864 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RELQ04864 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RELQ04864 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RELQ04864 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RELQ04864 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RELQ04864 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RELQ04864 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RELQ04864 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RELQ04864 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RELQ04864 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RELQ04864 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RELQ04864 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RELQ04864 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms