Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELAQ04206 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELAQ04206 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELAQ04206 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELAQ04206 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELAQ04206 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELAQ04206 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELAQ04206 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELAQ04206 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELAQ04206 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELAQ04206 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELAQ04206 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELAQ04206 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RELAQ04206 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RELAQ04206 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RELAQ04206 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RELAQ04206 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RELAQ04206 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RELAQ04206 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RELAQ04206 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RELAQ04206 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RELAQ04206 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELAQ04206 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RELAQ04206 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RELAQ04206 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RELAQ04206 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms