Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms