Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1DQ01668 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms