Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms