Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXK2Q01167 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXK2Q01167 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXK2Q01167 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXK2Q01167 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXK2Q01167 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXK2Q01167 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXK2Q01167 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXK2Q01167 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXK2Q01167 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXK2Q01167 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXK2Q01167 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXK2Q01167 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXK2Q01167 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXK2Q01167 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXK2Q01167 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms