Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms