Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPNP63162 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms