Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBA52P62987 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBA52P62987 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBA52P62987 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBA52P62987 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBA52P62987 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBA52P62987 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBA52P62987 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBA52P62987 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBA52P62987 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBA52P62987 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBA52P62987 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBA52P62987 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBA52P62987 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBA52P62987 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBA52P62987 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBA52P62987 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBA52P62987 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBA52P62987 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBA52P62987 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBA52P62987 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBA52P62987 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBA52P62987 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms