Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCS1P62166 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCS1P62166 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCS1P62166 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCS1P62166 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCS1P62166 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCS1P62166 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCS1P62166 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCS1P62166 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCS1P62166 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCS1P62166 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCS1P62166 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCS1P62166 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NCS1P62166 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCS1P62166 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCS1P62166 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCS1P62166 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCS1P62166 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NCS1P62166 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCS1P62166 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCS1P62166 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCS1P62166 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NCS1P62166 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCS1P62166 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCS1P62166 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCS1P62166 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCS1P62166 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCS1P62166 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCS1P62166 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCS1P62166 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCS1P62166 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCS1P62166 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCS1P62166 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCS1P62166 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCS1P62166 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCS1P62166 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCS1P62166 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCS1P62166 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCS1P62166 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCS1P62166 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCS1P62166 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCS1P62166 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCS1P62166 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCS1P62166 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCS1P62166 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCS1P62166 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCS1P62166 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCS1P62166 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCS1P62166 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCS1P62166 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCS1P62166 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCS1P62166 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCS1P62166 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCS1P62166 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCS1P62166 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms