Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms