Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms