Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH8P55286 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH8P55286 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH8P55286 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH8P55286 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH8P55286 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH8P55286 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH8P55286 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH8P55286 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH8P55286 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH8P55286 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH8P55286 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH8P55286 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH8P55286 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH8P55286 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH8P55286 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH8P55286 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH8P55286 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH8P55286 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH8P55286 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH8P55286 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH8P55286 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH8P55286 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH8P55286 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH8P55286 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH8P55286 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH8P55286 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH8P55286 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH8P55286 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH8P55286 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH8P55286 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH8P55286 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH8P55286 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH8P55286 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH8P55286 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms