Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAP1GDS1P52306 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAP1GDS1P52306 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms