Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DAP3P51398 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DAP3P51398 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DAP3P51398 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DAP3P51398 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DAP3P51398 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DAP3P51398 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DAP3P51398 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms