Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERFP50548 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERFP50548 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERFP50548 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERFP50548 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERFP50548 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERFP50548 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERFP50548 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERFP50548 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERFP50548 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERFP50548 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERFP50548 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERFP50548 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERFP50548 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERFP50548 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERFP50548 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERFP50548 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERFP50548 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERFP50548 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERFP50548 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERFP50548 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERFP50548 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERFP50548 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERFP50548 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERFP50548 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERFP50548 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERFP50548 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERFP50548 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERFP50548 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERFP50548 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERFP50548 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERFP50548 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERFP50548 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERFP50548 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERFP50548 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERFP50548 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ERFP50548 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERFP50548 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERFP50548 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERFP50548 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERFP50548 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ERFP50548 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERFP50548 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERFP50548 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERFP50548 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERFP50548 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERFP50548 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERFP50548 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERFP50548 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms