Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRE11P49959 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRE11P49959 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRE11P49959 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRE11P49959 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRE11P49959 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRE11P49959 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRE11P49959 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRE11P49959 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRE11P49959 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRE11P49959 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRE11P49959 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRE11P49959 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRE11P49959 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRE11P49959 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRE11P49959 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRE11P49959 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRE11P49959 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRE11P49959 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRE11P49959 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRE11P49959 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRE11P49959 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRE11P49959 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRE11P49959 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRE11P49959 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRE11P49959 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRE11P49959 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRE11P49959 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRE11P49959 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRE11P49959 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRE11P49959 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRE11P49959 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MRE11P49959 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRE11P49959 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRE11P49959 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRE11P49959 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRE11P49959 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRE11P49959 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRE11P49959 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRE11P49959 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRE11P49959 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MRE11P49959 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRE11P49959 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRE11P49959 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MRE11P49959 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRE11P49959 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRE11P49959 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRE11P49959 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRE11P49959 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRE11P49959 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRE11P49959 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRE11P49959 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRE11P49959 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRE11P49959 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRE11P49959 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRE11P49959 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRE11P49959 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRE11P49959 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRE11P49959 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms