Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFBP49765 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms