Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NESP48681 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NESP48681 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NESP48681 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NESP48681 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NESP48681 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NESP48681 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NESP48681 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NESP48681 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NESP48681 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
NESP48681 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NESP48681 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NESP48681 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
NESP48681 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NESP48681 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NESP48681 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
NESP48681 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NESP48681 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
NESP48681 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NESP48681 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NESP48681 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NESP48681 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NESP48681 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NESP48681 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NESP48681 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NESP48681 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NESP48681 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NESP48681 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NESP48681 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NESP48681 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NESP48681 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NESP48681 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
NESP48681 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NESP48681 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NESP48681 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NESP48681 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NESP48681 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NESP48681 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
NESP48681 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NESP48681 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NESP48681 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NESP48681 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NESP48681 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NESP48681 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NESP48681 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NESP48681 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NESP48681 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NESP48681 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NESP48681 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
NESP48681 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NESP48681 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
NESP48681 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NESP48681 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NESP48681 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NESP48681 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NESP48681 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NESP48681 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
NESP48681 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NESP48681 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NESP48681 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NESP48681 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NESP48681 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NESP48681 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NESP48681 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NESP48681 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NESP48681 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NESP48681 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NESP48681 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NESP48681 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NESP48681 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NESP48681 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NESP48681 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NESP48681 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NESP48681 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms