Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A11P48066 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms