Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms