Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms