Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RANGAP1P46060 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms