Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV4P43268 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV4P43268 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ETV4P43268 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ETV4P43268 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ETV4P43268 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ETV4P43268 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ETV4P43268 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ETV4P43268 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ETV4P43268 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ETV4P43268 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ETV4P43268 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ETV4P43268 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ETV4P43268 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ETV4P43268 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV4P43268 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV4P43268 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV4P43268 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV4P43268 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV4P43268 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV4P43268 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV4P43268 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV4P43268 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV4P43268 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV4P43268 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV4P43268 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ETV4P43268 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ETV4P43268 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV4P43268 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV4P43268 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV4P43268 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV4P43268 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV4P43268 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV4P43268 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV4P43268 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV4P43268 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV4P43268 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV4P43268 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV4P43268 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV4P43268 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV4P43268 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ETV4P43268 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ETV4P43268 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ETV4P43268 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms