Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL35P42766 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL35P42766 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL35P42766 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL35P42766 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL35P42766 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL35P42766 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL35P42766 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL35P42766 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL35P42766 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL35P42766 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL35P42766 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL35P42766 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL35P42766 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL35P42766 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL35P42766 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL35P42766 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL35P42766 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL35P42766 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL35P42766 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL35P42766 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL35P42766 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL35P42766 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL35P42766 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL35P42766 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL35P42766 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL35P42766 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL35P42766 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL35P42766 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms