Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPGP40121 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPGP40121 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPGP40121 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPGP40121 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPGP40121 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPGP40121 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPGP40121 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPGP40121 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPGP40121 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPGP40121 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPGP40121 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPGP40121 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPGP40121 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPGP40121 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPGP40121 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPGP40121 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPGP40121 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPGP40121 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPGP40121 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPGP40121 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPGP40121 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPGP40121 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPGP40121 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPGP40121 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPGP40121 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPGP40121 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPGP40121 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms